رنا غير مشفر طويل

الرنا غير المشفر الطويل (بالإنجليزية: Long non-coding RNA)‏ واختصارا (lncRNA) هو نوع من الرنا غير المشفر يُعرَّف على أنه نسخة يزيد طولها عن 200 نوكليوتيد ولا تتم ترجمتها إلى بروتين.^[2] هذا التعريف الاعتباطي نوعا ما يميز جزيئات الرنا غير المشفرة الطويلة عن جزيئات الرنا غير المشفرة الصغيرة مثل الرنا الميكروي، الرنا المتدخل الصغير، الرنا المتآثر مع بيوي، الرنا النويي الصغير، وغيرها من جزيئات الرنا القصيرة.^[3] جزيئات الرنا غير المشفرة الطويلة المتدخِّلة وجزيئات الرنا غير المشفرة الطويلة بين الجينية هي تسلسلات من الرنا غير المشفر الطويل والتي لا تتداخل مع الجينات المشفرة للبروتين.^[4]

الترجمة

كان هناك نقاش معتبر حول ما إن كانت جزيئات الرنا غير المشفر الطويل قد أُسِيءَ شرحها وتحديد وظيفتها وأنها بالفعل تشفر بروتينات وتخضع لعملية الترجمة. وُجِد بالفعل أن العديد من جزيئات الرنا الطويلة هذه تشفر ببتيدات ذات وظائف بيولوجية معتبرة.^[5]^[6]^[7] اقترحت دراسات برفلة الريبوسوم أن حوالي من 40% إلى 90% من جزيئات الرنا الطويلة المشروحة والمحددة تتم ترجمتها في الواقع،^[8]^[9] رغم وجود اختلاف حول الطريقة الصحيحة لدراسة وتحليل بيانات برفلة الريبوسوم.^[10] فضلا عن ذلك، يُعتقد أن العديد من الببتيدات الناتجة عن ترجمة جزيئات الرنا غير المشفر الطويل غير مستقرة بشكل كبير ومن دون وظائف بيولوجية.^[9]

مراجع

^ Fang R، Moss WN، Rutenberg-Schoenberg M، Simon MD (ديسمبر 2015). "Probing Xist RNA Structure in Cells Using Targeted Structure-Seq". PLoS Genetics. ج. 11 ع. 12: e1005668. DOI:10.1371/journal.pgen.1005668. PMC:4672913. PMID:26646615.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
^ Perkel JM (يونيو 2013). "Visiting "noncodarnia"". BioTechniques (paper). ج. 54 ع. 6: 301, 303–4. DOI:10.2144/000114037. PMID:23750541. "We're calling long noncoding RNAs a class, when actually the only definition is that they are longer than 200 bp," says Ana Marques, a Research Fellow at the University of Oxford who uses evolutionary approaches to understand lncRNA function.
^ Ma L، Bajic VB، Zhang Z (يونيو 2013). "On the classification of long non-coding RNAs". RNA Biology. ج. 10 ع. 6: 925–33. DOI:10.4161/rna.24604. PMC:4111732. PMID:23696037.
^ Julia D. Ransohoff, Yuning Wei & Paul A. Khavari (15 نوفمبر 2017). "The functions and unique features of long intergenic non-coding RNA". Nature Reviews Molecular Cell Biology. ج. 19 ع. 3: 143–157 (2018). DOI:10.1038/nrm.2017.104. PMC:5889127. PMID:29138516.
^ Anderson DM، Anderson KM، Chang CL، Makarewich CA، Nelson BR، McAnally JR، Kasaragod P، Shelton JM، Liou J، Bassel-Duby R، Olson EN (فبراير 2015). "A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance". Cell. ج. 160 ع. 4: 595–606. DOI:10.1016/j.cell.2015.01.009. PMC:4356254. PMID:25640239.
^ Matsumoto A، Pasut A، Matsumoto M، Yamashita R، Fung J، Monteleone E، Saghatelian A، Nakayama KI، Clohessy JG، Pandolfi PP (يناير 2017). "mTORC1 and muscle regeneration are regulated by the LINC00961-encoded SPAR polypeptide". Nature. ج. 541 ع. 7636: 228–232. Bibcode:2017Natur.541..228M. DOI:10.1038/nature21034. PMID:28024296.
^ Pauli A، Norris ML، Valen E، Chew GL، Gagnon JA، Zimmerman S، Mitchell A، Ma J، Dubrulle J، Reyon D، Tsai SQ، Joung JK، Saghatelian A، Schier AF (فبراير 2014). "Toddler: an embryonic signal that promotes cell movement via Apelin receptors". Science. ج. 343 ع. 6172: 1248636. DOI:10.1126/science.1248636. PMC:4107353. PMID:24407481.
^ Ingolia NT، Lareau LF، Weissman JS (نوفمبر 2011). "Ribosome profiling of mouse embryonic stem cells reveals the complexity and dynamics of mammalian proteomes". Cell. ج. 147 ع. 4: 789–802. DOI:10.1016/j.cell.2011.10.002. PMC:3225288. PMID:22056041.
^ ^ا ^ب Ji Z، Song R، Regev A، Struhl K (ديسمبر 2015). "Many lncRNAs, 5'UTRs, and pseudogenes are translated and some are likely to express functional proteins". eLife. ج. 4: e08890. DOI:10.7554/eLife.08890. PMC:4739776. PMID:26687005.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
^ Guttman M، Russell P، Ingolia NT، Weissman JS، Lander ES (يوليو 2013). "Ribosome profiling provides evidence that large noncoding RNAs do not encode proteins". Cell. ج. 154 ع. 1: 240–51. DOI:10.1016/j.cell.2013.06.009. PMC:3756563. PMID:23810193.

هذه بذرة مقالة عن التقانة الحيوية بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[1] Fang R، Moss WN، Rutenberg-Schoenberg M، Simon MD (ديسمبر 2015). "Probing Xist RNA Structure in Cells Using Targeted Structure-Seq". PLoS Genetics. ج. 11 ع. 12: e1005668. DOI:10.1371/journal.pgen.1005668. PMC:4672913. PMID:26646615.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)

[2] Perkel JM (يونيو 2013). "Visiting "noncodarnia"". BioTechniques (paper). ج. 54 ع. 6: 301, 303–4. DOI:10.2144/000114037. PMID:23750541. "We're calling long noncoding RNAs a class, when actually the only definition is that they are longer than 200 bp," says Ana Marques, a Research Fellow at the University of Oxford who uses evolutionary approaches to understand lncRNA function.

[3] Ma L، Bajic VB، Zhang Z (يونيو 2013). "On the classification of long non-coding RNAs". RNA Biology. ج. 10 ع. 6: 925–33. DOI:10.4161/rna.24604. PMC:4111732. PMID:23696037.

[The_functions_and_unique_features_of_long_intergenic_non-coding_RNA-4] Julia D. Ransohoff, Yuning Wei & Paul A. Khavari (15 نوفمبر 2017). "The functions and unique features of long intergenic non-coding RNA". Nature Reviews Molecular Cell Biology. ج. 19 ع. 3: 143–157 (2018). DOI:10.1038/nrm.2017.104. PMC:5889127. PMID:29138516.

[5] Anderson DM، Anderson KM، Chang CL، Makarewich CA، Nelson BR، McAnally JR، Kasaragod P، Shelton JM، Liou J، Bassel-Duby R، Olson EN (فبراير 2015). "A micropeptide encoded by a putative long noncoding RNA regulates muscle performance". Cell. ج. 160 ع. 4: 595–606. DOI:10.1016/j.cell.2015.01.009. PMC:4356254. PMID:25640239.

[6] Matsumoto A، Pasut A، Matsumoto M، Yamashita R، Fung J، Monteleone E، Saghatelian A، Nakayama KI، Clohessy JG، Pandolfi PP (يناير 2017). "mTORC1 and muscle regeneration are regulated by the LINC00961-encoded SPAR polypeptide". Nature. ج. 541 ع. 7636: 228–232. Bibcode:2017Natur.541..228M. DOI:10.1038/nature21034. PMID:28024296.

[7] Pauli A، Norris ML، Valen E، Chew GL، Gagnon JA، Zimmerman S، Mitchell A، Ma J، Dubrulle J، Reyon D، Tsai SQ، Joung JK، Saghatelian A، Schier AF (فبراير 2014). "Toddler: an embryonic signal that promotes cell movement via Apelin receptors". Science. ج. 343 ع. 6172: 1248636. DOI:10.1126/science.1248636. PMC:4107353. PMID:24407481.

[8] Ingolia NT، Lareau LF، Weissman JS (نوفمبر 2011). "Ribosome profiling of mouse embryonic stem cells reveals the complexity and dynamics of mammalian proteomes". Cell. ج. 147 ع. 4: 789–802. DOI:10.1016/j.cell.2011.10.002. PMC:3225288. PMID:22056041.

[:0-9] ا ^ب Ji Z، Song R، Regev A، Struhl K (ديسمبر 2015). "Many lncRNAs, 5'UTRs, and pseudogenes are translated and some are likely to express functional proteins". eLife. ج. 4: e08890. DOI:10.7554/eLife.08890. PMC:4739776. PMID:26687005.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)

[10] Guttman M، Russell P، Ingolia NT، Weissman JS، Lander ES (يوليو 2013). "Ribosome profiling provides evidence that large noncoding RNAs do not encode proteins". Cell. ج. 154 ع. 1: 240–51. DOI:10.1016/j.cell.2013.06.009. PMC:3756563. PMID:23810193.

[2]

[3]

[4]

[1]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]