صميم البروتين الشحمي E متعدد الأشكال،[10][11] وله ثلاث ألائل رئيسية (إبسيلون 2، إبسيلون 3، إبسيلون 4) حيث يحتوي الأليل APOE-ε2 (سيستئين في الموضع 112، وسيستئين في الموضع 158) والأليل APOE-ε3 (سيستئين في 112 وأرجنين في 158) والأليل APOE-ε4 (أرجنين في 112 وأرجنين في 158).[1][12][13] ورغم أن هذه الألائل تختلف عن بعضها البعض في حمض أو حمضين أمينيين فقط في الوضعيتين 112 و158،[14][15][16] إلا أن هذه الاختلافات تغير بنية ووظيفة صميم البروتين الشحمي E.
يرتبط هذا النظير من صميم البروتين بشكل ضعيف مع مستقبلات سطح الخلية، بينما يرتبط إبسيلون 3 وإبسيلون 4 جيدا.[18] إبسيلون 2 مرتبط بزيادة وانخفاض خطر تصلب الشرايين. الأفراد الذين يملكون توليفة E2/E2 (يملكون نسختين من هذا الأليل) قد يهضمون الأغذية الدهنية ببطء ويكونون عرضة بنسبة أكبر لأمراض وعائية مبكرة مثل الاضطراب الجينيشذوذ البروتين الشحمي بيتا في الدم العائلي[الإنجليزية]، 94.4% من المعانين من هذا المرض هم من فئة E2/E2 لكن حوالي 2% فقط من فئة E2/E2 يطورون هذا المرض، لذلك على الأرجج يوجد دور لعوامل أخرى بيئية وجينية في حدوثه (مثل الكولسترول في الغذاء والسن).[19][20][21] إبسيلون 2 له دور كذلك في مرض باركنسون،[22] لكن هذه النتائج لم يُتوصل إليها مجددا في دراسة ذات صلة شملت عدد أفراد أكبر.[23]
ميزة إيجابية لأليل E4 (مقارنة بـE2 وE3) هي ارتباطه الإيجابي مع مستويات عالية من فيتامين دي، الأمر الذي يمكن أن يشرح انتشاره رغم دوره الظاهر في مختلف الأمراض والاضطرابات.[39]
^ ابStolerman، Ian P.، المحرر (2010). Encyclopedia of Psychopharmacology (ط. Online). Berlin: Springer. ISBN:978-3540686989. {{استشهاد بكتاب}}: الوسيط غير المعروف |name-list-format= تم تجاهله يقترح استخدام |name-list-style= (مساعدة)
^Phillips MC (سبتمبر 2014). "Apolipoprotein E isoforms and lipoprotein metabolism". IUBMB Life. ج. 66 ع. 9: 616–23. DOI:10.1002/iub.1314. PMID:25328986.
^Singh PP، Singh M، Mastana SS (2006). "APOE distribution in world populations with new data from India and the UK". Annals of Human Biology. ج. 33 ع. 3: 279–308. DOI:10.1080/03014460600594513. PMID:17092867.
^Weisgraber KH، Innerarity TL، Mahley RW (مارس 1982). "Abnormal lipoprotein receptor-binding activity of the human E apoprotein due to cysteine-arginine interchange at a single site". The Journal of Biological Chemistry. ج. 257 ع. 5: 2518–21. PMID:6277903.
^Corder EH، Saunders AM، Strittmatter WJ، Schmechel DE، Gaskell PC، Small GW، Roses AD، Haines JL، Pericak-Vance MA (أغسطس 1993). "Gene dose of apolipoprotein E type 4 allele and the risk of Alzheimer's disease in late onset families". Science. ج. 261 ع. 5123: 921–23. Bibcode:1993Sci...261..921C. DOI:10.1126/science.8346443. PMID:8346443.
^ ابFarlow MR، He Y، Tekin S، Xu J، Lane R، Charles HC (نوفمبر 2004). "Impact of APOE in mild cognitive impairment". Neurology. ج. 63 ع. 10: 1898–901. DOI:10.1212/01.wnl.0000144279.21502.b7. PMID:15557508.