ويكيبيديا

فيروس ساربيكو

جنس فرعي من الفيروسات
اضغط هنا للاطلاع على كيفية قراءة التصنيف
اضغط هنا للاطلاع على كيفية قراءة التصنيف

فيروس ساربيكو

المرتبة التصنيفية جنيس[1][2]  تعديل قيمة خاصية (P105) في ويكي بيانات
تصنيف الفيروسات
المجموعة: فيروس
النطاق: ريبوفيريا
المملكة: أرثوورنافيرات
الشعبة: بيسوفيريكوتا
الطائفة: بيسونيفريسيتس
الرتبة: فيروسات عشية
الفصيلة: فيروسات تاجية
الأسرة: فيروس كورونا
الجنس: فيروس كورونا بيتا
الجنيس: فيروس ساربيكو
الاسم العلمي
Sarbecovirus[1][2]  تعديل قيمة خاصية (P225) في ويكي بيانات
تعديل مصدري - تعديل  طالع توثيق القالب

فيروس ساربيكو (بالإنجليزية: Sarbecovirus)‏ هو جنس فرعي من جنس فيروس كورونا بيتا يجمع فيروسات كورونا التي تسبب المتلازمة التنفسية الحادة الشديدة (السارس) والتي ينتمي إليها سارس-كوف-1 وسارس-كوف-2.[8][9]

الاسم الأجنبي ساربيكو منحوت من الحروف الأولى للكلمات: "SARS-like beta coronavirus" التي تعني فيروس كوروونا بيتا الشبيه بفيروس السارس. فيروسات الجنس الفرعي ساربيكو كانت تعرف سابقا باسم فيروسات كورونا المجموعة 2b.[10]

تستخدم فيروسات ساربيكو الإنزيم المحول للأنجيوتنسين (ACE2) كمستقبل، لكن لا يمكنها استخدام سوى مستقبلات ACE2 الخاصة ببعض الحيوانات فقط.[11] تصيب معظم فيروسات ساربيكو خفافيش حدوة الحصان لكن بعض السلالات تأقلمت مع ثدييات أخرى مثل: زباد النخل والغرير والإنسان كسارس-كوف، وآكل النمل الحرشفي سوندا والإنسان كسارس-كوف-2، وكذلك مختلف آكلات اللحوم (القطط، الببور، المنك الأمريكي والكلاب) التي ربما تعرضت للإصابة من البشر.[12]

تنظيم الجينوم

عدل

فضلا على المقارنات المبنية على تماثل تسلسل النوكليوتيدات داخل جنس فيروس كورونا بيتا، تتميز فيروسات الساربيكو بوجود العديد من إطارات القراءة المفتوحة بين جيني القفيصة النووية والغشاء.[10]

يتميز الجنس الفرعي فيروس ساربيكو بوجود بروتين واحد شبيه بالباباين (PLpro) في إطار القراءة المفتوح ORF1،[13] بدلا من اثنين كما هو الحال في الجنس الفرعي فيروس إمبيكو وجنس فيروس كورونا ألفا.[10]

الشجرة التطورية

عدل
موقع فيروسات ساربيكو من الشجرة التطورية لفيروسات كورونا بيتا.
فيروس كورونا بيتا










فيروس إمبيكو (تابع بالأسفل)












فيروس ميربيكو





فيروس كورونا القنفذ البري










فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية، فيروس كورونا الخفاش البني زولو







فيروس كورونا خفاش تيلونيكترايس HKU4





فيروس كورونا خفاش بيبيسترالوس HKU5







فيروس نوبيكو


فيروس كورونا خفاش راوستوس HKU9، فيروس كورونا خفاش راوستوس GCCDC1





فيروس هيبيكو

فيروس كورونا خفاش برات مستدير الورق جيجيانغ2013، فيروس كورونا خفاش زاريا


فيروس ساربيكو

فيروس كورونا BtKY72، فيروس كورونا BM48-31


فيروس كورونا المرتبط بالسارس

الفيروسات المرتبطة بسارس-كوف



الفيروسات المرتبطة بسارس-كوف-2








فيروس كورونا بيتا كلاد A 
(فيروس إمبيكو)


فيروس كورونا الفأري




فيروس التهاب الكبد الفأري (MHV)









فيروس كورونا الجرذي










فيروس كورونا البشري HKU1







فيروس كورونا لونغكوان راسل (LRLV)











فيروس كورونا الجرذ الصيني HKU24، فيروس كورونا جرذ الخط الأسود لونغكوان (LAMV)







فيروس كورونا الأرنبي HKU14



فيروس كورونا ميودس 2JL14



فيروس كورونا بيتا 1


فيروس كورونا الخيلي





فيروس التهاب الدماغ والنخاع الشوكي الراصي الخنزيري





فيروس كورونا البشري OC43



فيروس كورونا البقري








الفيروسات المرتبطة بسارس-كوف

عدل

شجرة تطور السلالات الخاصة بسلالة سارس-كوف والسلالات القريبة لها بناء على دراسات سلسلة كامل الجينوم.



  16BO133 التماثل مع سارس-كوف-1 82.8 % · خفاش الحذوة الكبير · جولا الشمالية، كوريا الجنوبية (عام الجمع 2016، عام النشر 2019)[14]





  Rf1‏ 87.8 % · خفاش الحذوة الكبير · ييتشانغ، خوبي الصين .(الجمع 2004، النشر 2005)[15]



  BtCoV HKU3‏ 87.9 % · خفاش حدوة الحصان الصيني الأصهب · هونغ كونغ، غوانغدونغ، الصين (الجمع 2004، النشر 2005، نشر عدة سلالات جديدة 2010)[16]





  LYRa11‏ 90.9 % · خفاش حدوة الحصان الوسطي · يُونْنَانْ، بواشان، الصين (الجمع 2011، النشر 2014)[17]




  Rp3‏ 92.6 % · خفاش حدوة الحصان بيرسون · قوانغشي، ناننينغ، الصين (الجمع 2004، النشر 2005)[15]




  SL-CoV YNLF-31C‏ 93.5 % · خفاش الحذوة الكبير · لوفينغ، يُونْنَانْ، الصين (الجمع 2013، النشر 2015)[18]



  SL-CoV YNLF-34C‏ 93.5 % · خفاش الحذوة الكبير · لوفينغ، يُونْنَانْ، الصين (الجمع 2013، النشر 2015)[18]







  SHC014‏ 95.4 % · خفاش حدوة الحصان الصيني الأصهب · كونمينغ، يُونْنَانْ، الصين (الجمع 2011، النشر 2013)[19]



  ويف1‏ 95.6 % · خفاش حدوة الحصان الصيني الأصهب · كونمينغ، يُونْنَانْ، الصين (الجمع 2012، النشر 2013)[19]




  ويف16‏ 96.0 % · خفاش حدوة الحصان الصيني الأصهب · كونمينغ، يُونْنَانْ، الصين (الجمع 2013، النشر 2016)[20]





  سارس-كوف زباد النخل 99.8 % · زباد النخل المقنع · غوانغدونغ، الصين.[16]



  سارس-كوف 100 %









  سارس-كوف-2 79 %


  فيروس خفاشي   فيروس زباد النخل   فيروس بشري

الفيروسات المرتبطة بسارس-كوف-2

عدل

شجرة تطور السلالات الخاصة بسلالة سارس-كوف-2 والسلالات القريبة لها[21][22] :



  Rc-o319 التماثل مع سارس-كوف-2 81 % · خفاش حدوة الفرس الياباني الصغير · إيواته، اليابان (عام الجمع 2013، عام النشر 2020) [23] ْ





  SL-ZXC21‏ 88 % · خفاش حدوة الحصان الصغير · زهوشان، جيجيانغ، الصين (الجمع 2015، النشر 2018) [24]



  SL-ZC45‏ 88 % · خفاش حدوة الحصان الصغير · زهوشان، جيجيانغن، الصين (الجمع 2017، النشر 2018) [24]





  فيروس كورونا آكل النمل الحرشفي-GX‏ 85.5 % · آكل النمل الحرشفي سوندا · جنوب شرق آسيا (الجمع 2017، النشر 2020)[25]




  فيروس كورونا آكل النمل الحرشفي-GD‏ 90.1 % · آكل النمل الحرشفي سوندا · جنوب شرق آسيا (الجمع 2019، النشر 2020)[26]





  RshSTT182‏ 92.6 % · خفاش حدوة حصان الشاملي · ستونغ ترينغ، كمبوديا (الجمع 2010، النشر 2021)[22]



  RshSTT200‏ 92.6 % · خفاش حدوة حصان الشاملي  · ستونغ ترينغ، كمبوديا (الجمع 2010، النشر 2021)[22]





  RacCS203‏ 91.5 % · خفاش حدوة حصان المستدق · شاشوينجساو، تايلاند (الجمع 2020، النشر 2021)[21]



  RmYN02‏ 93.3 % · خفاش حدوة حصان الملاياني · منغلا، يُونْنَانْ، الصين (الجمع 2019، النشر 2020)[27]





  RaTG13‏ 96.2 % · خفاش حدوة الحصان الوسطي · مقاطعة موجيانغ هاني ذاتية الحكم، يُونْنَانْ الصين (الجمع 2013، النشر 2020)[28]



  BANAL-52‏ 96.8%  · خفاش حدوة حصان الملاياني · فيينتيان، لاوس (النشر 2022)[29]



  سارس-كوف-2 100 %









  سارس-كوف 79%


  فيروس خفاشي   فيروس آكل النمل الحرشفي   فيروس بشري

انظر أيضا

عدل

مراجع

عدل
  1. ^ ا ب ج International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (17 Oct 2018), ICTV Master Species List 2018a v1 (بالإنجليزية), QID:Q57700017
  2. ^ ا ب ج International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (8 Mar 2019), ICTV Master Species List 2018b.v2 (بالإنجليزية), QID:Q62075759
  3. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (8 Mar 2019), ICTV Master Species List 2018b.v2 (بالإنجليزية), QID:Q62075759
  4. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (24 Apr 2020), ICTV Master Species List 2019.v1 (بالإنجليزية), QID:Q91806681
  5. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (18 May 2021), ICTV Master Species List 2020.v1 (بالإنجليزية), QID:Q106917282
  6. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (1 Nov 2022), ICTV Master Species List 2021.v3 (بالإنجليزية), QID:Q116118382
  7. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (8 Apr 2023), ICTV Master Species List 2022.v1 (بالإنجليزية), QID:Q118434107
  8. ^ "Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses including novel coronavirus from Wuhan using data generated by the Shanghai Public Health Clinical Center & School of Public Health, the National Institute for Viral Disease Control and Prevention, the Institute of Pathogen Biology, and the Wuhan Institute of Virology shared via GISAID". https://nextstrain.org/. 16 يناير 2020. مؤرشف من الأصل في 2023-03-15. اطلع عليه بتاريخ 2020-01-25. {{استشهاد ويب}}: روابط خارجية في |موقع= (مساعدة).
  9. ^ Antonio C. P. Wong, Xin Li, Susanna K. P. Lau et Patrick C. Y. Woo, « Global Epidemiology of Bat Coronaviruses », في Viruses, vol. 11, no 2, février 2019 [النص الكامل, lien PMID, lien DOI (pages consultées le 26 janvier 2020)]  "نسخة مؤرشفة" (PDF). مؤرشف من الأصل في 2022-03-20. اطلع عليه بتاريخ 2022-05-22.{{استشهاد ويب}}: صيانة الاستشهاد: BOT: original URL status unknown (link)
  10. ^ ا ب ج (بالإنجليزية) Patrick C. Y. Woo, Ming Wang, Susanna K. P. Lau et Huifang Xu, « Comparative Analysis of Twelve Genomes of Three Novel Group 2c and Group 2d Coronaviruses Reveals Unique Group and Subgroup Features », في Journal of Virology, vol. 81, no 4, 2007-02-15, ص.  1574–1585 ISSN 0022-538X [النص الكامل, lien PMID, lien PMCID, lien DOI (pages consultées le 2021-03-31)] .
  11. ^ دُوِي:10.1111/tbed.13792
  12. ^ (بالإنجليزية) Z. ZhouCatégorie:Utilisation du paramètre auteur dans le modèle article, « The taxonomy, host range and pathogenicity of coronaviruses and other viruses in the Nidovirales order », في Animal Diseases, vol. 1, no 5, 2021 [النص الكامل, lien DOI] .
  13. ^ Boni، Maciej F.؛ Lemey، Philippe؛ Jiang، Xiaowei؛ Lam، Tommy Tsan-Yuk؛ Perry، Blair W.؛ Castoe، Todd A.؛ Rambaut، Andrew؛ Robertson، David L. (28 يوليو 2020). "Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic". Nature Microbiology. Springer Science and Business Media LLC. ج. 5 ع. 11: 1408–1417. DOI:10.1038/s41564-020-0771-4. ISSN:2058-5276.
  14. ^ Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK (2019). "Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea". Virus Genes. ج. 55 ع. 4: 545–549. DOI:10.1007/s11262-019-01668-w. PMC:7089380. PMID:31076983.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  15. ^ ا ب Li، W. (2005). "Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses". Science. ج. 310 ع. 5748: 676–679. DOI:10.1126/science.1118391. ISSN:0036-8075.
  16. ^ ا ب Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi (2015). "BAT CORONAVIRUSES". في Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (المحرر). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition. John Wiley & Sons.{{استشهاد بكتاب}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  17. ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y؛ وآخرون (2014). "Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China". J Virol. ج. 88 ع. 12: 7070–82. DOI:10.1128/JVI.00631-14. PMC:4054348. PMID:24719429.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  18. ^ ا ب Lau، Susanna K. P.؛ Feng، Yun؛ Chen، Honglin؛ Luk، Hayes K. H.؛ Yang، Wei-Hong؛ Li، Kenneth S. M.؛ Zhang، Yu-Zhen؛ Huang، Yi؛ وآخرون (2015). "Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination". Journal of Virology. ج. 89 ع. 20: 10532–10547. DOI:10.1128/JVI.01048-15. ISSN:0022-538X.
  19. ^ ا ب Xing-Yi Ge؛ Jia-Lu Li؛ Xing-Lou Yang؛ وآخرون (2013). "Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor". Nature. ج. 503 ع. 7477: 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. DOI:10.1038/nature12711. PMC:5389864. PMID:24172901.
  20. ^ Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W؛ وآخرون (2016). "Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus". J Virol. ج. 90 ع. 6: 3253–6. DOI:10.1128/JVI.02582-15. PMC:4810638. PMID:26719272.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: أسماء متعددة: قائمة المؤلفين (link)
  21. ^ ا ب Wacharapluesadee S، Tan CW، Maneeorn P، Duengkae P، Zhu F، Joyjinda Y، وآخرون (فبراير 2021). "Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia". Nature Communications. ج. 12 ع. 1: 972. DOI:10.1038/s41467-021-21240-1. PMC:7873279. PMID:33563978.
  22. ^ ا ب ج Hul V, Delaune D, Karlsson EA, Hassanin A, Tey PO, Baidaliuk A, et al. (26 Jan 2021). "A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia". bioRxiv (بالإنجليزية). pp. 2021.01.26.428212. DOI:10.1101/2021.01.26.428212.
  23. ^ Murakami، Shin؛ Kitamura، Tomoya؛ Suzuki، Jin؛ Sato، Ryouta؛ Aoi، Toshiki؛ Fujii، Marina؛ Matsugo، Hiromichi؛ Kamiki، Haruhiko؛ Ishida، Hiroho؛ Takenaka-Uema، Akiko؛ Shimojima، Masayuki؛ Horimoto، Taisuke (2020). "Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan". Emerging Infectious Diseases. ج. 26 ع. 12: 3025–3029. DOI:10.3201/eid2612.203386. ISSN:1080-6040.
  24. ^ ا ب Hu، Dan؛ Zhu، Changqiang؛ Ai، Lele؛ He، Ting؛ Wang، Yi؛ Ye، Fuqiang؛ Yang، Lu؛ Ding، Chenxi؛ Zhu، Xuhui؛ Lv، Ruicheng؛ Zhu، Jin؛ Hassan، Bachar؛ Feng، Youjun؛ Tan، Weilong؛ Wang، Changjun (2018). "Genomic characterization and infectivity of a novel SARS-like coronavirus in Chinese bats". Emerging Microbes & Infections. ج. 7 ع. 1: 1–10. DOI:10.1038/s41426-018-0155-5. ISSN:2222-1751.
  25. ^ Lam، Tommy Tsan-Yuk؛ وآخرون (2020). "Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins". Nature. ج. 583 ع. 7815: 282–285. DOI:10.1038/s41586-020-2169-0. ISSN:0028-0836.
  26. ^ Xiao، Kangpeng؛ Zhai، Junqiong؛ Feng، Yaoyu؛ Zhou، Niu؛ Zhang، Xu؛ Zou، Jie-Jian؛ Li، Na؛ Guo، Yaqiong؛ Li، Xiaobing؛ Shen، Xuejuan؛ Zhang، Zhipeng؛ Shu، Fanfan؛ Huang، Wanyi؛ Li، Yu؛ Zhang، Ziding؛ Chen، Rui-Ai؛ Wu، Ya-Jiang؛ Peng، Shi-Ming؛ Huang، Mian؛ Xie، Wei-Jun؛ Cai، Qin-Hui؛ Hou، Fang-Hui؛ Chen، Wu؛ Xiao، Lihua؛ Shen، Yongyi (9 يوليو 2020). "Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins". Nature. ج. 583 ع. 7815: 286–289. DOI:10.1038/s41586-020-2313-x.
  27. ^ Zhou، Hong؛ Chen، Xing؛ Hu، Tao؛ Li، Juan؛ Song، Hao؛ Liu، Yanran؛ Wang، Peihan؛ Liu، Di؛ Yang، Jing؛ Holmes، Edward C.؛ Hughes، Alice C.؛ Bi، Yuhai؛ Shi، Weifeng (2020). "A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein". Current Biology. ج. 30 ع. 11: 2196–2203.e3. DOI:10.1016/j.cub.2020.05.023. ISSN:0960-9822.
  28. ^ Zhou، Peng؛ Yang، Xing-Lou؛ Wang، Xian-Guang؛ Hu، Ben؛ Zhang، Lei؛ Zhang، Wei؛ Si، Hao-Rui؛ Zhu، Yan؛ Li، Bei؛ Huang، Chao-Lin؛ Chen، Hui-Dong؛ Chen، Jing؛ Luo، Yun؛ Guo، Hua؛ Jiang، Ren-Di؛ Liu، Mei-Qin؛ Chen، Ying؛ Shen، Xu-Rui؛ Wang، Xi؛ Zheng، Xiao-Shuang؛ Zhao، Kai؛ Chen، Quan-Jiao؛ Deng، Fei؛ Liu، Lin-Lin؛ Yan، Bing؛ Zhan، Fa-Xian؛ Wang، Yan-Yi؛ Xiao، Geng-Fu؛ Shi، Zheng-Li (2020). "A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin". Nature. ج. 579 ع. 7798: 270–273. DOI:10.1038/s41586-020-2012-7. ISSN:0028-0836. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط غير المعروف |displayauthors= تم تجاهله يقترح استخدام |إظهار المؤلفين= (مساعدة)
  29. ^ Temmam، Sarah؛ Vongphayloth، Khamsing؛ Baquero، Eduard؛ Munier، Sandie؛ Bonomi، Massimiliano؛ Regnault، Béatrice؛ Douangboubpha، Bounsavane؛ Karami، Yasaman؛ Chrétien، Delphine؛ Sanamxay، Daosavanh؛ Xayaphet، Vilakhan؛ Paphaphanh، Phetphoumin؛ Lacoste، Vincent؛ Somlor، Somphavanh؛ Lakeomany، Khaithong؛ Phommavanh، Nothasin؛ Pérot، Philippe؛ Dehan، Océane؛ Amara، Faustine؛ Donati، Flora؛ Bigot، Thomas؛ Nilges، Michael؛ Rey، Félix A.؛ van der Werf، Sylvie؛ Brey، Paul T.؛ Eloit، Marc (16 فبراير 2022). "Bat coronaviruses related to SARS-CoV-2 and infectious for human cells". Nature. DOI:10.1038/s41586-022-04532-4.
 

هذه بذرة مقالة عن الفيروسات أو شيء يتعلق بها، بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

مجلوبة من «https://ar.wiki.x.io/w/index.php?title=فيروس_ساربيكو&oldid=63292746»