أباتشي سي تيكس

Apache CTAKES: تحليل النص السريري ونظام استخراج المعرفة هو نظام مفتوح المصدر لمعالجة اللغة الطبيعية (NLP) يستخرج المعلومات السريرية من النص غير الم

أباتشي cTAKES: نظام تحليل النص الإكلينيكي واستخراج المعرفة هو نظام مفتوح المصدر لمعالجة اللغات الطبيعية (NLP) يستخرج المعلومات الإكلينيكية أو الطبية من النص غير المنظم للسجلات الصحية الإلكترونية. يقوم بمعالجة الملاحظات الإكلينيكية، وتحديد أنواع الكيانات الطبية المسماة مثل الأدوية، الأمراض/الاضطرابات ، العلامات /الأعراض، الأجزاء التشريحية والإجراءات الطبية. يحتوي كل كيان مسمى على بعض السمات مثل رمز للربط ببعض الأنتولوجي الطبية المعروفة، سياق الكيان (تاريخ العائلة؟ ، حالي؟ ، غير مرتبط بالمريض؟) ، وما إذا كان الكيان منفي/غير منفي. [3]

تم بناء cTAKES باستخدام إطار عمل UIMA لإدارة المعلومات غير المهيكلة ومجموعة أدوات معالجة اللغات الطبيعية OpenNLP . [4]

المكونات

عدل

تم تدريب مكونات cTAKES خصيصًا للمجال الطبي، وإنشاء تعليقات لغوية ودلالية غنية يمكن استخدامها في أنظمة دعم القرارات والبحوث الطبية. [5]

تشمل هذه العناصر:

  • محدد الأقسام المسماة
  • كاشف حدود الجُمل
  • مجزئ الرموز القائم على القواعد
  • محدد القوائم
  • مُطَبِّع
  • مجزئ الرموز المعتمد على السياق
  • معلم أجزاء الكلام
  • مجزئ العبارات
  • المعلق المعتمد على القاموس
  • معلق السياق
  • كاشف النفي
  • كاشف عدم اليقين
  • كاشف الموضوع
  • محلل التبعية
  • محدد حالة تدخين المريض
  • معلق الأدوية

التاريخ

عدل

بدأ تطوير cTAKES في مايو كلينك في عام 2006. ضم فريق التطوير، بقيادة الدكتورة غيرجانا سافوفا والدكتور كريستوفر شوت، أطباء وعلماء كمبيوتر ومهندسي برمجيات. بعد نشره، أصبح cTAKES جزءًا لا يتجزأ من البنية التحتية لإدارة البيانات الطبية في مايو كلينك، حيث قام بمعالجة أكثر من 80 مليون ملاحظة طبية. [6]

عندما انتقلت الدكتورة سافوفا إلى مستشفى بوسطن للأطفال في أوائل عام 2010، نما فريق التطوير الأساسي ليشمل أعضاء من المستشفى. كما وتشمل أوجه التعاون الخارجية الإضافية: [6]

وقد أدى هذا التعاون إلى توسيع قدرات cTAKES في مجالات أخرى مثل التفكير الزمني، الإجابة على الأسئلة الطبية، وحل الإشارات للمجال الطبي. [6]

في عام 2010، تم اعتماد cTAKES بواسطة برنامج i2b2. بالإضافة إلى ذلك، يعتبر البرنامج مكون مركزي في SHARP Area 4 . [6]

في عام 2013 ، أصدرت cTAKES أول إصدار لها كمشروع حاضنة أباتشي: cTAKES 3.0 .

في مارس 2013، أصبح cTAKES مشروع عالي المستوى لأباتشي (TLP). [6]

انظر أيضًا

عدل

المراجع

عدل
  1. ^ ا ب وصلة مرجع: https://projects.apache.org/json/projects/ctakes.json. الوصول: 8 أبريل 2020.
  2. ^ "Release 6.0.0". 16 سبتمبر 2024. اطلع عليه بتاريخ 2024-09-17.
  3. ^ Denecke، Kerstin (31 أغسطس 2015). "Tools and Resources for Information Extraction". Health Web Science: Social Media Data for Healthcare. Springer. ص. 67. ISBN:978-3-319-20582-3 – عبر Google Books.
  4. ^ Khalifa، Abdulrahman؛ Meystre، Stéphane (1 ديسمبر 2015). "Adapting existing natural language processing resources for cardiovascular risk factors identification in clinical notes". Journal of Biomedical Informatics. Proceedings of the 2014 i2b2/UTHealth Shared-Tasks and Workshop on Challenges in Natural Language Processing for Clinical Data. ج. 58 ع. Supplement: S128–S132. DOI:10.1016/j.jbi.2015.08.002. PMC:4983192. PMID:26318122.
  5. ^ Savova، Guergana K؛ Masanz، James J؛ Ogren، Philip V؛ Zheng، Jiaping؛ Sohn، Sunghwan؛ Kipper-Schuler، Karin C؛ Chute، Christopher G (2010). "Mayo clinical Text Analysis and Knowledge Extraction System (cTAKES): architecture, component evaluation and applications". Journal of the American Medical Informatics Association. ج. 17 ع. 5: 507–513. DOI:10.1136/jamia.2009.001560. ISSN:1067-5027. PMC:2995668. PMID:20819853.
  6. ^ ا ب ج د ه "History". Apache cTAKES™ - clinical Text Analysis Knowledge Extraction System. 22 يونيو 2015. مؤرشف من الأصل في 2020-05-06. اطلع عليه بتاريخ 2018-01-11.

روابط خارجية

عدل